Das ZIK Septomics ist über seine Trägerinstitutionen hinaus vernetzt mit wissenschaftlichen Fachgesellschaften, nationalen und internationalen Forschergruppen sowie industriellen Kooperationspartnern.

• Deutsche Sepsis-Gesellschaft e.V.
• International Sepsis Forum
• Deutsche Gesellschaft für Hygiene und Mikrobiologie e.V.
• Paul-Ehrlich-Gesellschaft für Chemotherapie e.V.
• Vereinigung für Allgemeine und Angewandte Mikrobiologie
• European Society of Intensive Care Medicine
• Deutschsprachige Mykologische Gesellschaft e.V.
• Deutsche Sepsis-Hilfe e.V.
• Deutsche Gesellschaft für Immunologie e.V.
• Deutsche Gesellschaft für Pneumologie und Beatmungsmedizin e.V.
• European Respiratory Society

International

• Sepsis Alliance / Global Sepsis Alliance
• InFACT - A Global Initiative
• NIGMS Glue Grant: Inflammation and the host response to injury
• GenIMS: vom NIH (National Institutes of Health, USA) geförderte Multizenterstudie "Genetic and Inflammatory Markers of Sepsis"
• AspIRS: Aspergillosis individual risk stratification
• Internationales GRK 1673 “Functional Molecular Infection Epidemiology” (DFG)

EU / BMBF

• GenOSept: Genetics of Sepsis and Septic Shock
• SepNet - Kompetenznetz Sepsis
• PROGRESS: Pneumonia Research Network On Genetic Resistance and Susceptibility for the Evolution of Severe Sepsis (gemeinsames Forschungsvorhaben der BMBF-geförderten Netzwerke CAPNETZ, NGFN und SepNet)
• DFG Schwerpunktprogramm 1160: Kolonisation und Infektion human-pathogener Pilze
• Integriertes Forschungs- und Behandlungszentrum "Center for Sepsis Control and Care" am Universitätsklinikum Jena
• COSYCONET: COPD und systemische Begleiterkrankungen

• BioInstrumente Jena e.V.
• Beutenberg Campus e.V.

• BioControl Jena GmbH
• SIRS-Lab GmbH Jena
• InflaRx GmbH
• BioCentiv GmbH
• CLONDIAG GmbH

• Leibniz-Institut für Altersforschung - Fritz-Lipmann-Institut e.V. (FLI)
• ILRS - International Leibniz Research School for Microbial and Biomolecular Interactions als Teil der
  JSMC - Jena School for Microbial Communication
• Charité - Universitätsmedizin Berlin, Institut für Mikrobiologie und Hygiene